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Einfach und frei: Protein‐Ligand‐Docking

Wolfgang Sippl

08.06.2012

Von Wiley-VCH zur Verfügung gestellt

Algorithmen des molekularen Dockings sind Standardwerkzeuge der medizinischen Chemie. Sie dienen der In-silico-Vorhersage der Bindung arzneistoffähnlicher Moleküle an Target-Proteine und deren Konformation. Die Praxis fordert dabei eine genaue Vorhersage für wenige Verbindungen und eine schnelle Bewertung vieler Moleküle innerhalb virtueller Substanzdatenbanken: das virtuelle Screening. Aus mathematischer Sicht handelt es sich hierbei um ein kontinuierliches, mehrdimensionales Optimierungsproblem, das aus praktischen Erwägungen nur approximativ lösbar ist. In der Regel versucht dabei ein Verfahren, eine Zielfunktion zu optimieren, die Protein...

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